Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC015674.1-201ENST00000578482 267 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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