Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CTPS2-203ENST00000443824 4319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 API5-201ENST00000378852 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MAGEB1-203ENST00000397550 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ZSCAN9-202ENST00000425468 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SMARCAL1-202ENST00000358207 3056 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CSMD2-204ENST00000373380 4379 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 JADE1-213ENST00000610919 5644 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SEC16A-205ENST00000371706 8093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ACVR1-202ENST00000409283 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CCDC125-205ENST00000511257 1735 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ZBBX-203ENST00000392766 3250 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL137222.1-201ENST00000407765 1162 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 KCNIP2-AS1-201ENST00000412353 850 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TRAF3IP2-AS1-206ENST00000449449 784 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL033384.2-201ENST00000474641 456 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 AC092120.2-201ENST00000567166 415 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC067796.1-201ENST00000586795 496 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC087289.3-203ENST00000587556 550 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 KDM2A-212ENST00000530342 3651 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 CREM-204ENST00000345491 2220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 PREPL-202ENST00000378511 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 C3orf14-206ENST00000494481 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 INSC-202ENST00000379556 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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HOXD11P31277 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RASGRP4-217ENST00000615439 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC007038.1-201ENST00000452057 2199 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 KCTD21-201ENST00000340067 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 TGIF2LY-201ENST00000321217 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 IGLV2-14-201ENST00000390312 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC007362.1-208ENST00000423425 553 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC119428.1-201ENST00000429099 383 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL513122.2-201ENST00000437135 838 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL034397.1-201ENST00000456392 908 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RN7SL402P-201ENST00000465059 264 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 RPL23AP10-201ENST00000489946 466 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC091951.4-201ENST00000512746 332 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC091163.2-201ENST00000519032 460 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 AC073176.1-201ENST00000560700 534 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HOXD11P31277 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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