Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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