Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

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Length 5,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC008758.1-201ENST00000428311 4505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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HMCN1Q96RW7 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HMCN1Q96RW7 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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