Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ANKRD42Q8N9B4 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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