Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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CCDC142Q17RM4 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CCDC142Q17RM4 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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CCDC142Q17RM4 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CCDC142Q17RM4 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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