Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RFTN1Q14699 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms