Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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GPS1Q13098 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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GPS1Q13098 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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GPS1Q13098 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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GPS1Q13098 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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GPS1Q13098 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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GPS1Q13098 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GPS1Q13098 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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