Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTPN13Q12923 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTPN13Q12923 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTPN13Q12923 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTPN13Q12923 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPN13Q12923 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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