Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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PTPRAP18433 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRAP18433 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
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