Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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PTPRCP08575 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PTPRCP08575 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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