Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC002367.1-201ENST00000416765 405 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 PCNAP3-201ENST00000397222 778 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL355490.2-201ENST00000422848 548 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 MTRF1-204ENST00000430347 557 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RPE-210ENST00000438204 796 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 APOPT1-206ENST00000476323 757 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 C4orf22-205ENST00000508675 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
LINC00587B1AMM8 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.3 ms