Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP18Q9UMW8 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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