Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CHPF2Q9P2E5 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHPF2Q9P2E5 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms