Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNTN3Q9P232 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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