Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC9Q96Q05 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms