Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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AP5B1Q2VPB7 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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AP5B1Q2VPB7 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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AP5B1Q2VPB7 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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AP5B1Q2VPB7 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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AP5B1Q2VPB7 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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AP5B1Q2VPB7 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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AP5B1Q2VPB7 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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AP5B1Q2VPB7 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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AP5B1Q2VPB7 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
AP5B1Q2VPB7 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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