Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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ECM1Q16610 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
ECM1Q16610 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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