Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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SIX1Q15475 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SIX1Q15475 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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