Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NEUROD1Q13562 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms