Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
EIF4EBP1Q13541 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms