Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SP140Q13342 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SP140Q13342 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SP140Q13342 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SP140Q13342 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SP140Q13342 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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SP140Q13342 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SP140Q13342 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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