Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
FOXO1Q12778 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXO1Q12778 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms