Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
POLKQ9UBT6 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
POLKQ9UBT6 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
POLKQ9UBT6 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
POLKQ9UBT6 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
POLKQ9UBT6 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
POLKQ9UBT6 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
POLKQ9UBT6 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
POLKQ9UBT6 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
POLKQ9UBT6 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
POLKQ9UBT6 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
POLKQ9UBT6 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
POLKQ9UBT6 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms