Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 BBS4-201ENST00000268057 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 CCDC39-201ENST00000442201 3279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 OR1G1-201ENST00000328890 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC090835.1-201ENST00000515189 1024 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AL391903.2-201ENST00000614532 247 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 RXFP1-207ENST00000470033 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 IL5RA-206ENST00000430514 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC139256.1-201ENST00000569858 2598 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 HELQ-201ENST00000295488 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 LPL-201ENST00000311322 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 ELMO2-202ENST00000352077 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 LACTB2-AS1-201ENST00000499227 3716 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 MUCL1-202ENST00000546809 439 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 ACP5-208ENST00000590420 301 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
BCL11BQ9C0K0 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms