Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CIPCQ9C0C6 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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