Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC009269.1-203ENST00000496414 828 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 LRP4-AS1-202ENST00000531719 731 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ANKRD42Q8N9B4 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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