Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC104447.1-201ENST00000624214 2124 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LTBP4Q8N2S1 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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