Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms