Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC02250-201ENST00000422117 2491 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NEUROD1Q13562 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms