Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD10P28358 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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