Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CTPS1P17812 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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