Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

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Length 828 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
COG3Q96JB2 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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COG3Q96JB2 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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COG3Q96JB2 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COG3Q96JB2 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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