Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PDK4Q16654 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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PDK4Q16654 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PDK4Q16654 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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