Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TXLNB-201ENST00000358430 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CCDC144B-208ENST00000618081 8688 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 COL25A1-208ENST00000610288 4799 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 HSBP1-201ENST00000433866 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 EPHA5-206ENST00000622150 8421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PRDM10-201ENST00000304538 5817 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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