Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CDH18Q13634 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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