Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CUL4BQ13620 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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