Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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