Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CHAF1AQ13111 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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CHAF1AQ13111 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CHAF1AQ13111 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CHAF1AQ13111 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CHAF1AQ13111 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CHAF1AQ13111 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CHAF1AQ13111 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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