Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ADGRE1-205ENST00000450315 2567 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 MOSPD1-203ENST00000370783 2364 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 XRCC6P4-201ENST00000518193 2067 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPL15P1-201ENST00000439981 600 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC005840.2-201ENST00000447193 355 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC009229.1-201ENST00000450854 622 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC112219.1-201ENST00000491567 947 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 PAQR9-AS1-202ENST00000493825 576 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.29-201ENST00000616220 280 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL022318.4-202ENST00000622217 591 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LRRC49-203ENST00000443425 3085 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 GPNMB-202ENST00000381990 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 HERC2P8-202ENST00000564334 3705 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ACTR6-201ENST00000188312 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 C1orf116-202ENST00000461135 3142 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 UACA-203ENST00000539319 4026 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ATP6V0D2-201ENST00000285393 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 THAP12P6-201ENST00000431978 2310 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TRIM60P19-201ENST00000452879 1462 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 BRDT-204ENST00000394530 3207 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CPNE8-201ENST00000331366 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TDP1-202ENST00000393452 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ZNF300P1-201ENST00000356555 1822 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 KCNJ15-207ENST00000398934 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 S100A13-204ENST00000440685 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC008799.1-201ENST00000495909 457 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC087521.3-201ENST00000528226 553 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LCMT1-AS1-202ENST00000563962 766 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 PRR13P4-201ENST00000577786 421 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SLFN5-203ENST00000592325 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TRBV10-3-201ENST00000611462 368 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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