Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CHRNEQ04844 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms