Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PSMB9P28065 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms