Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AKAP7-202ENST00000342266 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CHCHD3P2-201ENST00000550751 639 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 AC012557.3-201ENST00000626439 255 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PTPREP23469 LINC00954-202ENST00000449086 2995 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 HIST1H4F-201ENST00000244537 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTPREP23469 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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