Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPCAMP16422 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms