Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC61Q9Y6R9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC61Q9Y6R9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms