Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms