Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COL4A3BPQ9Y5P4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms