Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NRXN3Q9Y4C0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms