Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHTOPQ9Y3Y2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHTOPQ9Y3Y2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms