Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOP58Q9Y2X3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms